敦煌地区的西北风最多,且风力强,对月牙泉的威胁最大。当西北风沿着山坡下来时,风向发生改变,向西南吹去。部分进入泉区的风,遇到的是一个环形山洼,形成向上作离心运动的旋风,反而把带来的沙子和白天被游人踩落的沙子吹向四周的山坡或者抛向山峰的背面。所以,风沙不仅没有埋没月牙泉,而且人们还惊奇地发现,由于白天爬山、滑沙等活动被大量踩落的沙子,到了第二天又神奇地恢复原貌了。
从全年来看,泉内外均盛行偏西风和偏东风,泉内外的偏西风增存在一个固定角度的偏转,泉内相对于泉外顺时针方向偏转了22.5℃左右。偏东风(以东北风为主)在泉内外顺时针旋转45℃左右,成为东风。当外转围盛行偏北风时,小泉湾处以N(东北)和ENE(东北东)为主,西口以偏东北风为主,泉内以偏西北风为主。